Muzeum im. Przypkowskich w Jędrzejowie gromadzi, przechowuje, konserwuje i udostępnia dobra kultury w zakresie historii nauki, historii kultury materialnej, historii oraz sztuki, prowadzi działalność oświatową w zakresie wspomnianych dyscyplin, a także współdziała w upowszechnianiu nauki i sztuki z instytucjami, organizacjami i stowarzyszeniami o podobnych celach.

Muzeum realizuje cele określone powyżej w szczególności poprzez:

- gromadzenie dóbr kultury i materiałów dokumentujących w zakresie gnomoniki i historii pomiaru czasu, astronomii i nauk            pokrewnych, grafiki, bibliofilstwa, gastronomii i historii regionu jędrzejowskiego,

- inwentaryzowanie, katalogowanie i naukowe opracowanie zgromadzonych muzealiów i materiałów dokumentacyjnych,                książek  i czasopism,

- przechowywanie zgromadzonych muzealiów w warunkach zapewniających im pełne bezpieczeństwo i magazynuje w sposób    dostępny dla celów naukowych,

- zabezpieczenie i konserwacja muzealiów,

- organizowanie wystaw stałych, czasowych oraz imprez artystycznych,

- prowadzenie działalności edukacyjnej, wydawniczej i informacyjnej,

- udostępnianie zbiorów dla celów naukowych i oświatowych,

- publikowanie katalogów, przewodników wystaw, wyników badań naukowych oraz materiałów informacyjnych reklamowych z      zakresu swej działalności,

- zapewnianie właściwych warunków zwiedzania oraz korzystania ze zbiorów i zgromadzonych informacji,

          - przyjmowanie darowizn w postaci zbiorów oraz przejmowanie depozytów od osób prywatnych i instytucji.